Bioimage et Bioinformatique

Responsable de la plateforme : Jean-Luc EVRARD

Description

La plateforme Bioimage et Bioinformatique assure une mission fédérative pour  des unités de recherche du CNRS et de L’Université de Strasbourg. Elle met à disposition de ses partenaires :

  • la puissance de calcul apportée par un cluster de 64 coeurs
  • des outils de bioinformatique
  • l’hébergement de projets et des données scientifiques associées
  • l’accompagnement de projets de traitement de données ou de développement de logiciels.

Pour en savoir plus

Expertises

  • Pôle Bioinformatique (Valérie COGNAT)
  • Pôle Développement (Gaël PAWLAK)
  • Pôle Infrastructure et réseaux (Jean-Luc EVRARD)

Expertises

Pôle Bioinformatique

Responsable : Valérie COGNAT

 

Le pôle Bioinformatique a pour vocation de répondre aux besoins des différentes équipes partenaires de la plateforme. Les activités sont principalement la gestion des outils bioinformatiques, des projets et la formation.

Pôle Développement

Responsable : Gaël PAWLAK

 

Le pôle développement suit deux axes, la réalisation d’outils support d’une part et la valorisation applicative de connaissances scientifiques.

Pôle Infrastructure et réseaux

Responsable : Jean-Luc EVRARD

 

Le pôle Infrastructure et réseaux conçoit, déploie, met en oeuvre et coordonne l’architecture réseau et matérielle de la plateforme. Il assure la mise en place et l’exploitation de l’ensemble des serveurs et des services associés.

Membres de la plateforme

Dernières publications

  • SCHALK Catherine, COGNAT V., GRAINDORGE S., VINCENT T., VOINNET Olivier and MOLINIER J.

    Small RNA-mediated repair of UV-induced DNA lesions by the DNA DAMAGE BINDING protein 2 and ARGONAUTE 1

    Proceedings of the National Academy of Sciences U S A, :, 2017. | PMI10.1073/pnas.1618834114 :

  • MONTAVON T., KWON Y., ZIMMERMANN A., HAMMANN Philippe, VINCENT T., COGNAT V., MICHEL F. and DUNOYER P.

    A specific dsRNA-binding protein complex selectively sequesters endogenous inverted-repeat siRNA precursors and inhibits their processing

    Nucleic Acids Research, 45(3):1330-1344, 2017. | PMI28180322 :

  • COGNAT V., MORELLE G, MEGEL C, LALANDE S., MOLINIER J., VINCENT T., SMALL I, DUCHÊNE A. and MARÉCHAL-DROUARD L.

    The nuclear and organellar tRNA-derived RNA fragment population in Arabidopsis thaliana is hygly dynamic

    Nucleic Acids Research, :Epub ahead of print, 2016. | PMI27899576 :

  • SCHALK Catherine, DREVENSEK Stéphanie, KRAMDI Amira, KASSAM Mohamed, AHMED Iklhak, COGNAT V., GRAINDORGE S., BERGDOLL M., BAUMBERGER N., HEINTZ D., BOWLER Chris, GENSCHIK P., BARNECHE Fredy, COLOT Vincent and MOLINIER J.

    DNA DAMAGE BINDING PROTEIN 2 (DDB2) Shapes the DNA Methylation Landscape

    Plant Cell, :, 2016.

  • BATZENSCHLAGER M., HLEIBIEH K., JANSKI N, HOULNÉ G., HERZOG E., EVRARD J., BAUMBERGER N., ERHARDT M., NOMINÉ Y., KIEFFER B., SCHMIT A. and CHABOUTE M.

    The GIP gamma-tubulin complex-associated proteins are involved in nuclear architecture in Arabidopsis thaliana.

    Frontiers in Plant Science, 4(480):doi:10.103389/fpls.2013.00480, 2013. | PMI24348487 :

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