Bioinformatique et infrastructure

Responsable de la plateforme : Jean-Luc EVRARD

Description

La plateforme Bioinformatique et infrastructure assure une mission fédérative pour  des unités de recherche du CNRS et de L’Université de Strasbourg. Elle met à disposition de ses partenaires :

  • la puissance de calcul apportée par un cluster de 64 coeurs
  • des outils de bioinformatique
  • l’hébergement de projets et des données scientifiques associées
  • l’accompagnement de projets de traitement de données ou de développement de logiciels.

Pour en savoir plus

Expertises

  • Pôle Bioinformatique (Valérie COGNAT)
  • Pôle Développement (Gaël PAWLAK)
  • Pôle Infrastructure et réseaux (Jean-Luc EVRARD)

Expertises

Pôle Bioinformatique

Responsable : Valérie COGNAT

 

Le pôle Bioinformatique a pour vocation de répondre aux besoins des différentes équipes partenaires de la plateforme. Les activités sont principalement la gestion des outils bioinformatiques, des projets et la formation.

Pôle Développement

Responsable : Gaël PAWLAK

 

Le pôle développement suit deux axes, la réalisation d’outils support d’une part et la valorisation applicative de connaissances scientifiques.

Pôle Infrastructure et réseaux

Responsable : Jean-Luc EVRARD

 

Le pôle Infrastructure et réseaux conçoit, déploie, met en oeuvre et coordonne l’architecture réseau et matérielle de la plateforme. Il assure la mise en place et l’exploitation de l’ensemble des serveurs et des services associés.

Membres de la plateforme

Dernières publications

  • VINCENT T., VINGADASSALON A., UBRIG E., AZEREDO K., SROUR O., COGNAT V., GRAINDORGE S., SALINAS-GIEGÉ T., MARÉCHAL-DROUARD L. and DUCHÊNE A.

    A genome-scale analysis of mRNAs targeting to plant mitochondria: upstream AUGs in 5’-UTRs reduce mitochondrial association

    Plant Journal, 92:1132-1142, 2017. | PMI29044717 :

  • CÓRDOBA-CAÑERO Dolores, COGNAT V., ARIZA Rafael, ROLDÁN ARJONA Teresa and MOLINIER J.

    Dual control of ROS1-mediated active DNA demethylation by the DNA DAMAGE BINDING protein 2 (DDB2)

    Plant Journal, :, 2017. | PMI29078035 :

  • SCHALK Catherine, COGNAT V., GRAINDORGE S., VINCENT T., VOINNET Olivier and MOLINIER J.

    Small RNA-mediated repair of UV-induced DNA lesions by the DNA DAMAGE BINDING protein 2 and ARGONAUTE 1

    Proceedings of the National Academy of Sciences U S A, :, 2017. | PMI28325872 :

  • MONTAVON T., KWON Y., ZIMMERMANN A., HAMMANN Philippe, VINCENT T., COGNAT V., MICHEL F. and DUNOYER P.

    A specific dsRNA-binding protein complex selectively sequesters endogenous inverted-repeat siRNA precursors and inhibits their processing

    Nucleic Acids Research, 45(3):1330-1344, 2017. | PMI28180322 :

  • SALINAS-GIEGÉ T., CAVAIUOLO Marina, COGNAT V., UBRIG E., REMACLE Claire, DUCHÊNE A., VALLON Olivier and MARÉCHAL-DROUARD L.

    Polycytidylation of mitochondrial mRNAs in Chlamydomonas reinhardtii

    Nucleic Acids Research, 15:12963-12973, 2017.

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