Métabolomique

Responsable de la plateforme : Dimitri HEINTZ

Description

Notre groupe est spécialisé dans le développement de méthodologies basées sur des techniques de chromatographie et de spectrométrie de masse pour l’identification de petites molécules bioactives. Ces petites molécules sont nommées «métabolites» lorsqu’elles proviennent d’organismes vivants. La discipline scientifique qui consiste à identifier les métabolites se nomme la métabolomique. Ce terme métabolomique est apparu dans les années 1990.

Notre activité consiste donc à identifier finement les métabolites chez les plantes, qui contiennent la plus grande réserve de métabolites (> 40000) mais également chez les animaux, chez l’homme et chez les microorganismes.

Notre laboratoire est certifié ISO9001 depuis 2013 pour les activités de service, recherche et formation.

Expertises

  • Compréhension sur le plan fondamental des réseaux métaboliques (Julie ZUMSTEG)
  • Cartographie de métabolites de plantes importants pour la santé humaine (Julien DELECOLLE)
  • Métabolomique environnementale
  • Recherche de biomarqueurs métaboliques de maladies humaines

Expertises

Compréhension sur le plan fondamental des réseaux métaboliques

Responsable : Julie ZUMSTEG

Un enjeu majeur pour l’agriculture moderne responsable passe par une meilleure compréhension sur le plan fondamental des réseaux métaboliques qui gouvernent les mécanismes de croissances, de défenses et d’adaptation des plantes. Dans cet objectif notre groupe développe des méthodologies qui permettent d’identifier les métabolites clés de ces mécanismes importants.

Cartographie de métabolites de plantes importants pour la santé humaine

Responsable : Julien DELECOLLE

Les plantes sont le plus grand réservoir de métabolites et 80% des médicaments utilisés en médecine dérivent des métabolites de plantes. Nous avons un projet en partenariat avec l’industrie qui consiste à identifier des métabolites de plantes dans des produits homéopathiques ayant des effets sur la santé humaine.

Métabolomique environnementale

Le projet consiste à identifier des micropolluants (résidus médicamenteux, HAP, pesticides) présents dans des eaux usées, des sols pollués ainsi qu’à identifier des plantes capables d’éliminer ces micropolluants.

Recherche de biomarqueurs métaboliques de maladies humaines

Nous sommes engagés dans deux projets, l’un consiste à rechercher des marqueurs de la maladie à Corps de Lewy à travers une étude comparative avec des patients atteints de la maladie d’Alzheimer. L’autre étude porte sur la recherche de marqueurs de la maladie de Crown.

Membres de la plateforme

Dernières publications

  • SMIRNOVA E., MARQUIS V., POIRIER L., AUBERT Yann, ZUMSTEG J., MENARD R., MIESCH Laurence and HEITZ T.

    Jasmonic Acid Oxidase 2 (JAO2) hydroxylates jasmonic acid and represses basal defense and resistance responses against Botrytis cinerea infection

    Molecular Plant, 10(9):1159-1173, 2017. | PMI10.1016/j.molp.2017.07.010 :

  • SCHALK Catherine, DREVENSEK Stéphanie, KRAMDI Amira, KASSAM Mohamed, AHMED Iklhak, COGNAT V., GRAINDORGE S., BERGDOLL M., BAUMBERGER N., HEINTZ D., BOWLER Chris, GENSCHIK P., BARNECHE Fredy, COLOT Vincent and MOLINIER J.

    DNA DAMAGE BINDING PROTEIN 2 (DDB2) Shapes the DNA Methylation Landscape

    Plant Cell, :, 2016. | PMI27531226 :

  • TABET R., MOUTIN E., BECKER J.A.J., HEINTZ D., FOUILLEN L., FLATTER E., KREZEL W., ALUNNI V., KOEBEL P., DEMBÉLÉ D., TASSONE F., BARDONI B., MANDEL J.L., VITALE N., MULLER D., LE MERRER J. and MOINE H.

    Fragile X mental retardation protein (FMRP) controls diacylglycerol kinase activity in neurons

    Proceedings of the National Academy of Sciences U S A, 113(26):3619-28, 2016. | PMI27233938 :

  • AGIN A., HEINTZ D., RUHLAND E., CHAO DE LA BARCA J.M., ZUMSTEG J., MOLA V., GAUCHEZ A.S. and NAMER I.J.

    Metabolomics - an overview. From basic principles to potential biomarkers (part 1)

    Medecine Nucleaire, 40:4-10, 2016.

  • ALAMGEER P., CHABERT P., AKHTAR M.S., JABEEN Q., DELECOLLE J., HEINTZ D., GARO E., HAMBURGER M., AUGER C., LUGNIER C., KIM H.J., OAK M.H. and SCHINI-KERTH V.B

    Endothelium-independent vasorelaxant effect of a Berberis orthobotrys root extract via inhibition of phosphodiesterases in the poricine coronary artery

    Phytomedicine, 23:793-799, 2016. | PMI27288914 :

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