Bactéries du sol et agriculture durable : caractérisation génomique et biologique de Streptomyces isolés de l’orge

Les bactéries du genre Streptomyces jouent un rôle central dans les écosystèmes du sol, à la fois comme acteurs de la fertilité des sols, interagissant étroitement avec les plantes pour apporter des bénéfices nutritionnels, permettre une meilleure croissance ou résistance contre les pathogènes. Leur exploration représente un levier majeur pour le développement de stratégies agricoles durables.

Dans une étude publiée dans BMC Microbiology, un consortium majoritairement composé de chercheurs de l’IBMP et dirigé par Florence Ploetze propose une caractérisation intégrée de souches de Streptomyces isolées de l’orge (Hordeum vulgare). Cette étude combine analyses génomiques approfondies, phénotypage biologique et approches fonctionnelles afin d’évaluer le potentiel de ces souches comme bactéries bénéfiques pour les plantes.

Les résultats mettent en évidence une grande diversité génétique et métabolique, associée à des capacités biologiques clés : production de métabolites secondaires, interactions avec les plantes, potentiel de biocontrôle et contribution possible à la nutrition végétale. L’analyse des génomes révèle la présence de nombreux clusters de biosynthèse de composés bioactifs, certains sont souche-spécifiques, soulignant la richesse fonctionnelle de ces microorganismes.

Cette approche intégrative permet de mieux comprendre le rôle écologique de ces bactéries dans les agroécosystèmes, leur spécificité et leur potentiel en tant qu’outils biologiques pour une agriculture plus durable, réduisant la dépendance aux intrants chimiques tout en renforçant la résilience des cultures.