Analyse de l’expression génique

Préparation à façon, validation et séquençage des banques d’ADN et d’ARN.

Applications

• Séquençage de génomes
• Séquençage d’amplicons
• Séquençage ciblé : Adaptive Sampling sequencing
• Édition génomique & épigénétique: Détection des variations structurales
• Séquençage du  transcriptome:  RNA-seq , cDNA-Seq / variants d’épissage
• Séquençage du MicroRNome: small RNA-seq , détection des variations structurales

Débit

• 800 à  2675 pores
• Jusqu’à 100 Gb en 72h
• Multiplexage

Préparation à façon, validation et séquençage des banques d’ADN et d’ARN.

Applications

• Séquençage de génomes et d’amplicons
• Édition génomique & épigénétique: Chip-seq
• Séquençage du  transcriptome:  RNA-seq
• Séquençage du MicroRNome: small RNA-seq, Mime-seq
• Ribosome profilling: Ribo-seq
• Séquençage de microbiome: 16S-rRNA-seq

Débit

• Jusqu’à 50 millions de paired-end reads
• Longueur de séquençage maximale : 1 x 600 cycles ou 2 x 300 cycles en 56 heures)
• Jusqu’à 15 Gb de données
• Multiplexage à façon

Nous proposons une service de séquençage complet et assemblage de novo de vos plasmides (insert et/ou vecteur).

Applications

• Validation du squelette de vos plasmides
• Validation de vos clonages , séquençage complets des inserts

Débit

• Jusqu’à 192 plasmides en parallèle
• Assemblage de novo automatisé

Analyse d’expression de gènes à haut débit par PCR quantitative en temps réel, la plateforme propose différents services :

Applications

• Dessin et validation d’amorces et sondes
• Quantifications relative et absolue
• Validation de résultats de RNA-seq
• Quantification de librairies NGS

Débit

• Bloc PCR de 384 puits pour l’analyse à haut débit
•  Jusqu’à 8 runs en 24 heures

Le HRM est une méthode économique pour le génotypage à haut débit.

Applications

• Génotypage de SNP (classes 1 à 4)
• Criblage de mutants Crispr/Cas9
• Détection de mutations indels
• Détection et quantification des méthylations sur l’ADN
• Identification de pathogènes

Débit

• Jusqu’à 192 échantillons en 2 heures

La PCR numérique est la troisième génération de PCR après la PCR au point final et la PCR en temps réel. Cette technologie permet une quantification numérique très précise des acides nucléiques contenus dans les échantillons biologiques.

Applications

• Quantification absolue & expressions de gènes (<2 x différences)
• Détection et quantification des RNAs rares ou peu abondants
• Détection et quantification des transcrits alternatifs
• Analyses des miRNAs
• Variation du nombre de copies (CNV)
• Détection de pathogènes (charges virales , analyse de microbiome)

Débit

• Jusqu’à 48 chambres par run
• Analyse de 48 échantillons en multiplex (3) / détection de 144 cibles par run.
• 20000 gouttelettes/chambre (volume de goutte de 0,22 nl)
• LOD 0,2 copies/µl
• Gamme dynamique = 5 log