Equipe : Biogenèse et traduction des ARNt
Chef d’équipe : Philippe GIEGE
Courriel : philippe.giege@ibmp-cnrs.unistra.fr
Directrice de thèse : Thalia SALINAS
Courriel : thalia.salinas@ibmp-cnrs.unistra.fr
Les mitochondries sont des organites endosymbiotiques apparus il y a deux milliards d’années, transformant l’évolution des eucaryotes. Elles sont au cœur de la bioénergétique, fournissant de l’ATP aux cellules eucaryotes. Chlamydomonas reinhardtii est une algue verte unicellulaire. Son génome mitochondrial combine des caractéristiques de plantes terrestres avec une architecture ressemblant à celle des mitochondries de mammifères, ce qui en fait un modèle unique. Notre laboratoire a pu déterminer la structure du mitoribosome de Chlamydomonas, en identifiant des protéines pouvant aider à la reconstitution des ARN ribosomiques fragmentés qui composent le mitoribosome de l’algue. De plus, nos travaux ont montré que les ARNm mitochondriaux de Chlamydomonas initient la traduction au niveau du codon AUG sans séquences leader, un processus dont les mécanismes restent inconnus.
Le travail proposé vise à caractériser le processus d’initiation de la traduction dans les mitochondries de Chlamydomonas. S’appuyant sur de solides données préliminaires, ce projet multidisciplinaire utilisera une combinaison d’approches génétiques, de séquençage de nouvelle génération, biochimiques et structurelles (c’est-à-dire immunoprécipitation, Ribo-Seq, Cryo-EM) pour identifier sans a priori de nouveaux facteurs impliqués dans l’initiation de la traduction mitochondriale des algues, identifier leur interaction avec les facteurs universels d’initiation de la traduction et déterminer leur mode d’action. Comprendre comment l’ARNm et l’ARNt sont recrutés dans le mitoribosome et comment la traduction est initiée contribuera à démêler la diversité des mécanismes de traduction chez les eucaryotes.
Mots-clés : Chlamydomonas, algues, mitochondries, machinerie traductionnelle, ARN, transcriptomique, protéomique
Publications pertinentes :
- Waltz, F., Salinas-Giegé, T., Englmeier, R. et al. (2021) Comment construire un ribosome à partir de fragments d’ARN dans les mitochondries de Chlamydomonas. Nat Commun 12, 7176. https://doi.org/10.1038/s41467-021-27200-z
- Salinas-Giegé, T., Cavaiuolo, M., Cognat, V. et al. (2017) Polycytidylation des ARNm mitochondriaux chez Chlamydomonas reinhardtii, Nucleic Acids Research, Volume 45, Numéro 22, Pages 12963–12973, https://doi.org/10.1093/nar/gkx903
- Salinas, T., Duby, F., Larosa, V. et al. (2012) La co-évolution de l’importation et de l’utilisation des codons de l’ARNt mitochondrial détermine l’efficacité de la traduction chez l’algue verte Chlamydomonas. PLoS Genet, 8(9):e1002946, https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1002946
Le soutien financier de ce sujet est assuré par le Pôle de Recherche / LabEx MitoCross
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