Métabolomique – MASS

Responsables de la plateforme : Hubert SCHALLEREmmanuel GAQUEREL

Description

Metabolomics Analysis of Small-molecule Signatures
L’IBMP dispose d’une expertise internationalement reconnue dans l’étude ciblée du métabolisme et l’analyse à très haute résolution des métabolomes de plantes. Ce savoir-faire, soutenu par les activités de recherche de plusieurs équipes de l’IBMP, permet de combiner des compétences uniques, intégrées à la plateforme MASS de métabolomique. Cette plateforme, adossée aux équipes de recherche, propose un large éventail de méthodes analytiques, à la fois ciblées et exploratoires, pour répondre aux besoins de l’ensemble des équipes de l’institut. Par ailleurs, cette expertise est également mise à disposition de divers organismes, ainsi que de laboratoires publics et privés.

Contact | mass@ibmp-cnrs.unistra.fr

Expertises

Expertises analytiques

Portfolio de méthodes développées au sein de la plateforme et des équipes |

  • Profilage semi-ciblé par GC-FID / GC-MS et LC-UV / LC-MS d’acides gras et de leurs dérivés oxydés, de triterpènes, de stérols, de terpénoïdes et de dérivés phénoliques.
  • Profilage ciblé par LC-MS d’hormones végétales (jasmonates, gibbérellines, auxine, acide abscissique et acide salicylique)
  • Profilage ciblé par LC-MS de métabolites primaires (sucres, acides organiques et acides aminés)
  • Profilage ciblé par LC-MS de nucléotides modifiés d’acide s nucléiques
  • Analyse métabolomique (non-ciblée) par GC-MS du métabolisme central carboné
  • Analyse métabolomique (non-ciblée) par LC-MS haute résolution
  • Expertise approfondie dans l’analyse computationnelle (open source) de données métabolomiques couvrant le processing, l’annotation ainsi que l’analyse statistique de celles-ci.

Instrumentations

  • Chromatographie en phase gazeuse : GC-qqqMS (Bruker), GC-MS (Agilent), GC-ToFMS (Leco) et GC-FID (Agilent)
  • Chromatographie en phase liquide : UPLC-PDA-qToFMS (Bruker), UPLC-qqqMS (Bruker), HPLC semi-préparative-PDA-qMS (Agilent / Waters), UPLC-PDA (Waters) et HPLC-PDA (Agilent)
  • Imagerie par spectrométrie de masse : (UPLC)-FT-ICRMS (SolariX Bruker) (et HTX M5 Sprayer [HTX Technologies] et cryomicrotome [Thermo Scientific])
  • Système d’analyse de surface d’extraction liquide (LESA Advion, connectable à UPLC-PDA-qToFMS)
  • Système HPTLC (Chromacim)
  • Préparation d’échantillons SPE
  • Concentrateurs sous vide SpeedVac (Thermo Scientific)
  • Générateurs de gaz (hydrogène, azote, air)

Prestations

Les prestations proposées le sont sur la base du portfolio de méthodes implémentées au sein de la plateforme MASS.

  • Prestations internes: formation et accès accompagné aux expérimentateurs | réalisation des analyses et traitement des données selon le type d’analyse et les projets
  • Prestations externes : discutées sur la base de la tarification en vigueur ou de contrats de prestations.

Membres de la plateforme