L’Institut de Biologie Moléculaire des Plantes (IBMP) est fier de proposer 7 bourses de doctorat IMCBio entièrement financées pour 2025. Situé à Strasbourg, au carrefour de l’innovation et de la collaboration Européenne, l’IBMP offre un environnement exceptionnel pour mener des recherches de pointe en biologie végétale.
Projets de Doctorat Disponibles
Voici un aperçu des projets passionnants auxquels vous pouvez participer :
- Duchêne/Drouard – Fission mitochondriale dans les mitochondries des plantes (PhD-2025-12) : Ce projet vise à étudier les mécanismes de la fission mitochondriale chez Arabidopsis thaliana, un processus essentiel à l’adaptation cellulaire au stress. En combinant des approches de protéomique avancée et des études fonctionnelles, il vise à identifier les réseaux protéiques régulant la dynamique mitochondriale chez les plantes.
- Genschik – Mécanismes et rôle de la séparation de phase d’AGO1 chez Arabidopsis (PhD-2025-18) : Ce projet explore comment ARGONAUTE1 (AGO1) forme des condensats en réponse au stress et l’impact de ces condensats sur son rôle dans la régulation post-transcriptionnelle et la défense antivirale. En combinant des approches génétiques, protéomiques et transcriptomiques, l’étude vise à élucider les mécanismes moléculaires de la séparation de phase d’AGO1 et ses implications physiologiques.
- Gagliardi/Zuber – Déterminants moléculaires façonnant les queues poly(A) des ARNm chez Arabidopsis (PhD-2025-19) : Ce projet de thèse vise à caractériser les déterminants génétiques responsables de la distribution spécifique des queues poly(A) des ARNm chez Arabidopsis, révélées par le séquençage Nanopore. En combinant analyses fonctionnelles, purification par affinité, spectrométrie de masse et apprentissage automatique, l’objectif est de comprendre les mécanismes sous-jacents à cette régulation post-transcriptionnelle et son impact sur la stabilité, la traduction et la localisation des ARNm.
- Giegé/Salinas – Initiation de la traduction dans les mitochondries de Chlamydomonas (PhD-2025-23) : Ce projet de thèse vise à caractériser le processus d’initiation de la traduction dans les mitochondries de Chlamydomonas reinhardtii, une algue verte unicellulaire au génome mitochondrial unique. En s’appuyant sur des données préliminaires solides, ce projet multidisciplinaire combinera génétique, séquençage de nouvelle génération, biochimie et approches structurales (immunoprécipitation, Ribo-Seq, Cryo-EM) pour identifier de nouveaux facteurs impliqués, comprendre leur interaction avec les facteurs universels d’initiation de la traduction et élucider leur mode d’action.
- Giegé/Castanet – Régulation de l’homéostasie des ARN double-brins dans les chloroplastes (PhD-2025-27) : Ce projet de thèse vise à combler une lacune dans nos connaissances sur le contrôle qualité des ARN (QC) dans les chloroplastes, en explorant le rôle des ARN double-brins (dsRNA) dans l’expression et la régulation des gènes chloroplastiques. En s’appuyant sur des outils de séquençage de pointe (Illumina et Nanopore) et des techniques telles que le dsRIP-Seq et l’immunolocalisation, le projet identifiera les duplex ARN-ARN dans des mutants de ribonucléases et sous conditions de stress, tout en caractérisant de nouveaux facteurs protéiques impliqués dans le métabolisme des dsRNA.
- Blevins/Weixlbaumer – Analyse structure-fonction de l’ARN polymérase IV chez le tétraploïde Nicotiana benthamiana (PhD-2025-33) : Ce projet vise à élucider comment les caractéristiques structurelles de l’ARN polymérase IV (Pol IV) et de ses facteurs de recrutement CLSY permettent la transcription d’ARN non codants dans la chromatine silencieuse. À l’aide de Nicotiana benthamiana comme modèle, l’étudiant caractérisera les complexes CLSY-Pol IV par des approches de génétique fonctionnelle (CRISPR/Cas9) et d’analyse phylogénétique, étudiera les sous-unités Pol IV d’origines parentales distinctes, et purifiera des complexes Pol IV liés aux nucléosomes pour en déterminer la structure à haute résolution par cryo-microscopie électronique. Ces travaux approfondiront notre compréhension de la régulation épigénétique et pourraient ouvrir de nouvelles perspectives pour l’amélioration des plantes.
- Ritzenthaler – Étude approfondie d’une nouvelle protéine liant l’ARN présentant des propriétés structurelles uniques (PhD-2025-36) : Les virus à ARN exploitent des usines virales membranaires pour répliquer leurs génomes, générant des ARN double brin (dsRNA), éléments clés de la défense antivirale. En étudiant ces dsRNA chez Arabidopsis, nous avons identifié une protéine conservée, dotée d’une forte affinité pour les dsRNA, potentiellement impliquée dans l’immunité innée des plantes. Ce projet vise à élucider la fonction de cette protéine en conditions normales et lors d’infections virales, à l’aide de mutants CRISPR-Cas9 et d’analyses transcriptomiques. Les mécanismes moléculaires seront explorés par microscopie avancée, co-immunoprécipitation et études structurales de complexes protéine-dsRNA, offrant de nouvelles perspectives sur l’immunité des plantes.
Pourquoi Choisir l’IBMP ?
- Des infrastructures à la pointe dans les domaines de la biologie moléculaire, de la génomique et de l’imagerie.
- Une communauté internationale dynamique de chercheurs.
- Des opportunités pour relever des défis mondiaux en science végétale, de l’adaptation au changement climatique à la sécurité alimentaire.
📅 Date limite de candidature : janvier 2025
🌐 Plus d’informations et candidatures : https://imcbio-phdprogram.unistra.fr
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